Фонд Музея детского изобразительного искусства народов Сибири и Дальнего Востока имеет более восьми тысяч экспонатов и включает в себя две основные коллекции: коллекция произведений детского творчества и коллекция работ профессиональных художников.

Коллекция произведений детского искусства включает работы мальчиков и девочек Сибири: различные скульптуры, рисунки, гравюры, изделия декоративно-прикладного искусства. В том числе работы традиционного искусства народов Бурятии, Приамурья, Тывы, Хакасии, Чукотки и Якутии. Сибирскую коллекцию произведений детского творчества удачно дополняет в музее зарубежная коллекция. Комплект зарубежной коллекции состоит из рисунков подрастающего поколения почти из сорока стран мира. Все музейные экспонаты составляют основу различных выставок и просветительских детских мероприятий. Приоритетными направлениями деятельности Музея детского изобразительного искусства народов Сибири и Дальнего Востока являются организация городских, региональных, всесибирских, международных выставок произведений творчества детей одной из выбранных зарубежных стран, экспозиции детских работ художественных, общеобразовательных школ, изобразительных студий, демонстрация накопленного опыта работы педагогов с детьми, а также организация персональных выставок творческих произведений детей и художников.